微生物肥料是由一種或數種有益微生物、經工業化培養發酵而成的生物性肥料，應用于農用生產，通過其中所含微生物的生命活動，增加植物養分的供應量或促進植物生長，提高產量，改善農產品品質及農業生態環境。特別是保護地蔬菜生產中，針對連年超量施肥，土壤中殘余大量未被吸收成分，對土質造成破壞引起的土壤鹽化、酸化，通過施用生物菌肥，可明顯起到改良土壤、減少化肥用量、提高蔬菜品質的作用。
農業部批準登記的微生物肥料產品共有9個菌劑類品種和2個菌肥類品種。
根瘤菌劑、固氮菌劑、溶磷菌劑、硅酸鹽菌劑、菌根菌劑、光合菌劑、有機物料腐熟劑、復合菌劑和土壤修復菌劑。
微生物菌劑具有直接或間接改良土壤、恢復地力、維持根際微生物區系平衡、降解有毒有害物質等作用。
復合微生物肥料是把無機營養元素、有機質、微生物菌有機結合于一體，體現無機化學肥料、有機肥料以及微生物肥料的綜合效果，是化解土壤板結現象，修復和調理土壤，提高化學肥料利用率，提高果實品質及產量的首推肥料。
生物有機肥是指特定功能微生物與主要以動植物殘體為來源并經無害化處理、腐熟的有機物料復合而成的一類兼具微生物肥料和有機肥效應的肥料。
生物肥料（微生物肥料）的功效是一種綜合作用，主要是與營養元素的來源和有效性有關，或與作物吸收營養、水分和抗?。ㄏx）有關。總體來說，生物肥料（微生物肥料）的作用為以下幾點：
7、微生物肥料不宜久放，拆包后要及時施用，注意產品保質期。